درصورت بروز حادثه اي در آزمايشگاه مانند شكستن محيط كشت يا ظروف حاوي نمونه هاي باليني، ممكن است نياز به ضدعفوني كردن اتاق باشد. اين عمل بايد بوسيله افراد مجرب انجام شود. اگر حادثه ناشي از شكستن ظروف حاوي محيط كشت جامد يا خلط غليظ باشد، تعداد آئروسل هاي ايجاد شده ناشي از آن محدود است. بنابراين بلافاصله محل آلوده را با كاغذ و حتي روپوش آزمايشگاهي مي پوشانند تا از ايجاد آئروسل جلوگيري شود. بسرعت ماده ضدعفوني كننده را  در محل آلوده ريخته و اتاق را حداقل بمدت 2 ساعت ترك مي كنند. پس از 2 ساعت، با پوشيدن لباس محافظ وارد اتاق شده و ظروف شكسته را جمع آوري كرده، منطقه آلوده را كاملا" ضدعفوني و تميز مي نمايند.

چنانچه حادثه ناشي از شكستن ظروف حاوي مايعات آلوده باشد، در اينصورت ميزان آئروسل ايجاد شده زياد است. بنابراين بيدرنگ هود ايمني را روشن كرده، حداقل تا 4 ساعت اتاق حادثه را ترك مي كنند. سپس اتاق را با گاز فرمالدئيد ضدعفوني مي نمايند.

دو فرد مجرب براي ضدعفوني و گندزدايي اتاق مورد نياز است. در ابتدا تمامي پنجره ها،  درها و منافذ اتاق مورد نظر بايد به دقت مسدود شود كه براي اين كار مي توان از كيسه هاي پلاستيكي بزرگ زباله استفاده كرد. فرمالدئيد، ممكن است موجب خرابي تجهيزات كامپيوتري شود، بنابراين قبل از ضدعفوني كردن بايد وسايل مزبور را از محيط خارج كرد. براي ضدعفوني كردن 30 متر مكعب، ml 100 فرمالين و ml 900 آب با يك اجاق برقي لازم است. تمامي مواد شيميايي حاوي كلرين (chlorine) مانند مواد ضدعفوني كننده هيپوكلريت بايد از اتاق خارج شوند زيرا ممكن است كلرومتيل (chloromethyl) توليد گردد كه سرطان زا است.

مراحل گندزدايي اتاق آزمايشگاه

1. يك نفر وارد اتاق شده، محلول فرمالين و آب را روي اجاق برقي گذاشته و خارج مي شود. درصورت امكان اجاق بايد خارج از اتاق روشن يا خاموش گردد. اين عمل را مي توان با قطع و وصل فيوز اتاق مورد نظر انجام داد.
2. پس از تبخير كامل فرمالدئيد، برق اتاق را قطع مي كنند ولي تا 12 ساعت، درهاي اتاق بسته مي ماند تا گاز بتواند تمامي فضاي اتاق را ضدعفوني كند.
3. روز بعد يك نفر با ماسك و لباس محافظ، بسرعت وارد اتاق شده، فن هود ايمني را روشن مي كند، سپس اتاق را براي مدتي ترك مي كند تا هواي اتاق تميز شود.
4. چنانچه در روي سطوح، پودر سفيد رنگ ماده ضدعفوني كننده باقيمانده باشد آن را مي توان با هيدروكسيدآمونيوم 10 % پاك كرد. از آنجائيكه غلظت بيش از اندازه گاز فرمالدئيد خطر انفجار دارد,  بايد توجه داشت كه در حين ضدعفوني كردن فضاي اتاق، ميزان غلظت گاز فرمالدئيد بيشتر از mg 5/2 در متر مكعب هوا نباشد. براي تعيين ميزان غلظت گاز در فضا، مي توان از دستگاه اندازه گيري غلظت گاز استفاده كرد.

•  شايان ذكر است كه گاز فرمالدئيد توسط سطوح مختلف جذب شده و موجب پليمريزه شدن مواد موجود مي شود. به همين علت سطوح قابل شستشو ازجمله ديوارها را بايد توسط مايع سولفيت سديم شستشو داد.